Vlajkovou lodí mikroskopické laboratoře Katedry archeologie FF UHK se stal digitální 3D mikroskop firmy Keyence VHX 6000. Laboratoř se podařilo vybavit sestavou, která zahrnuje plně motorizovaný stolek umožňující jemný automatický posuv v osách x, y a z, tři objektivy pokrývající zvětšení od 0x po 2000x a pozorování v rozličných světelných podmínkách (kruhové, koaxiální, procházející a jejich kombinace) a software pro 3D analýzu obrazu. Mikroskop tak umožňuje z nasnímané sekvence obrázků skládat 3D obraz a provádět přesná mikroskopická měření v trojrozměrném prostoru. V archeologii mikroskop využíváme pro kvantitativní analýzu morfologie, textury a dalších tvarových jevů na povrchu archeologických artefaktů, ale také např. pro kvantitativní analýzu petrografických výbrusů. Mikroskop totiž umožňuje mapovat povrch ve vysokém prostorovém rozlišení a následně kvantitativně analyzovat zachycené jevy.
